FLCL: Centros alternativos das desventuras de Kana, 17 anos, uma júnior do ensino médio que passa seus dias saindo com seus melhores amigos, Mossan, Hijiri e Pets. Eles vivem vidas extraordinárias, até o dia em que um Mecha cai do céu, junto com uma mulher estranha chamada "Haruko".